對于如何對新能源進行補貼，財政部財政科學研究所副研究員王晨表示，在實施新能源財稅政策轉型過程中，財政需要在支持光伏、風電等新能源發展過程中發揮導向作用，進一步增加對新能源發展的研發投入和示范補助，設立專項資金和新能源發展基金，從源頭上把關，將其作為公共財政支出的重點；同時通過財政支出結構的調整和優化，推進節能減排，進而優化經濟結構，實施新能源政策戰略部署。“此外，中央財政應根據各地區新能源發展的實施情況和工作成效進行考核，根據實際考核結果再進行獎勵資金清算，突出績效導向作用。”
 
　　從補貼范圍來看，目前我國財政補貼比較傾向于風電產業、太陽能產業和生物質能產業，而對地熱能、海洋能等產業的財政補貼相對較少，在推進新能源財稅政策轉型時可以考慮加大補貼范圍，使得新能源產業結構均衡發展。此外，有專家指出，應該加大對電網投入的財政補貼，不僅對并網技術的研發給予補貼，而且對電網輸出基礎設施加大投入，這樣能在一定程度上緩解新能源產能過剩。
 
　　國家能源委員會專家咨詢委員會主任、國家發改委原副主任張國寶認為，在發展新能源問題上，多方應該轉變自己的心態和職能。像核電或者大的發電站，需要在選址和安全性方面由政府審批；像風電、太陽能這種本身容量不大且非常分散的項目，就沒有必要都拿到中央層面上去批，應該讓市場去決定。在一個企業非常弱小的情況下，政府給一點補貼，可能在某一個發展階段是必不可少的。但給予補貼就好像吃西藥，能治病，也有副作用。副作用是什么呢？就是企業會不求進取，不想進一步花大力氣去降低生產成本。所以給每度電多少錢的補貼，不如把這些錢用來支持新能源技術，或者給新能源發展創造降低成本的條件，這樣可能更為公平。
 
　　對新能源企業進行補貼，多數行業人表示理解，但是對于其中的一些問題，要進行全面的思考，這當中會不會產生瞞報謊報領“空響”的行為、考察評定會不會產生腐敗問題。
 
　　粗放式的財政補貼方式，導致補貼資金零散，各種科研機構爭相爭奪財政補貼資金，企業跑馬圈地，各個地方政府盲目建設新能源產業園，甚至有縣級政府以此前的摩托車、三輪車生產廠為基地興建新能源汽車產業園的現象。應當看到，財政補貼雖然能夠刺激市場擴張，但這并不是最終目的。與發達國家的補貼重點在消費者，主要在于市場應用推廣不同，目前中國的財政補貼幾乎覆蓋所有產業鏈。而在補貼申報的過程中，由于財政部門比較難以對申請資格進行足夠的考核，難免會導致財政資金被浪費和低效率的情況。
 
　　補貼應掌握好度
 
　　新能源補貼要采取系統化方式，應有主有次，且對于主次進行有必要的階段化的發展，這關系到行業正確健康的發展。要從基本國情和產業發展現狀出發，采取更加有力、更加符合國際通行規則的補貼政策。
 
　　山西大學商務學院徐俊表示，加快整合和梳理現行補貼政策。首先，要明確部門責任，盡快把分散在各個部門、各個文件中的補貼政策加以歸攏，集中使用有限資源，發揮最大效用。其次，要時刻關注國際相關的政策動態。同時，要確定重點補貼環節。與基礎研究補貼不同，產業技術類補貼都是以產業化生產、商業化推廣為最終目標的。我國新能源各產業處于不同的發展階段，不宜一刀切，選擇各自重點補貼環節，將錢花在刀刃上，用小投入換來產業的大振興。補貼的目的是為了形成競爭力，既不能過長，導致企業躺在政府身上不思進取；也不能過短，導致半途而廢無功而返。新能源產業補貼，要結合產業發展，予以明確。我國目前的新能源產業補貼，要及時動態調整補貼依據，以更好地符合產業發展趨勢。不要導致企業為獲取補貼，不愿擴大銷售規模。要不要補充新的補貼標準，要盡早研究。