可再生能源配額制與可交易綠色證書機制配套的具體做法是：政府在電力生產(chǎn)和銷售中強制要求可再生能源發(fā)電在電力供應(yīng)中必須達到的一定比例，并對相應(yīng)的責(zé)任主體（電力生產(chǎn)商、電力零售商等）形成配額，即一定時期內(nèi)必須完成的一定量的可再生能源電力生產(chǎn)或電量消費，否則將面臨處罰。同時，政府對責(zé)任主體所完成可再生能源電力生產(chǎn)或電量消費進行核準，并頒發(fā)相應(yīng)的綠色證書，以此憑證來與配額相匹配，未能完成配額的責(zé)任主體可以購買超額完成配額的責(zé)任主體的多余的綠色證書，來彌補其應(yīng)盡的配額責(zé)任。可再生能源配額制和可交易綠色證書機制的結(jié)合，可以彌補政府對可再生能源發(fā)展補貼政策的缺陷。
首先，政府通過配額制明確了可再生能源的發(fā)展目標(biāo)，并將該目標(biāo)分解到相關(guān)責(zé)任方，同時以市場化綠色證書交易機制和嚴厲的處罰措施作為保障，能夠保證實現(xiàn)既定的發(fā)展目標(biāo)。可再生能源發(fā)展配額目標(biāo)的確定非常重要，因為如果目標(biāo)過低，綠色證書供給就會過多，其價格也會偏低，出售綠色證書的所得不足以補償清潔電力的生產(chǎn)，這就難以鼓勵清潔電力的生產(chǎn)。反之，如果目標(biāo)過高，綠色證書供給就會偏少，其價格可能偏高，甚至超過不達標(biāo)罰款，供應(yīng)商寧可承受罰款，也不買綠色證書。
其次，綠色證書的價格，代表了可再生能源高于常規(guī)能源發(fā)電成本的差額，通過交易可以實現(xiàn)這種成本差額在整個電力行業(yè)的均攤，扭轉(zhuǎn)可再生能源發(fā)電的成本劣勢，提高可再生能源的市場競爭力。
再次，綠色證書的價格也反映了可再生能源的環(huán)境效益，綠色證書的購買者對環(huán)境的污染（包括溫室氣體排放）給社會帶來了更多的負外部性，必須為此付出相應(yīng)的代價，而綠色證書交易實現(xiàn)了這種負外部性的內(nèi)在化。
最后，綠色證書的價格由市場競爭形成，可以不受政府干預(yù)，能夠及時反映可再生能源發(fā)電成本的變化，更有效地支持可再生能源產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。正是由于可交易綠色證書機制具備以上優(yōu)越性，所以它正迅速取代傳統(tǒng)的補貼政策，成為發(fā)達國家新能源和可再生能源發(fā)展的重要政策工具。
通常說的綠色電價機制，其長期目標(biāo)就是建立配額制和綠色證書交易體系，將政府政策支持和市場機制調(diào)節(jié)有效結(jié)合。根據(jù)目前我國的可再生能源發(fā)展現(xiàn)狀，推行可再生能源配額制度的時機應(yīng)該成熟了，并進一步將其與可交易綠色證書機制配套，隨著電力體制改革進程的深入，促使可再生能源逐步在經(jīng)濟性上參與電力市場競爭。
