目前，可再生能源上網電價高于常規能源發電平均上網電價的差額部分，通過在全國范圍對銷售電量征收可再生能源電價附加籌集。從2006年到目前，我國可再生能源電價附加標準從最初的每千瓦時0.1分錢提高至1.9分錢，但電價附加標準的提高始終滯后于可再生能源發展的需求。到2015年年底，可再生能源補貼資金累計缺口400多億元。
　　
　　這一方面的原因是作為可再生能源補貼重要來源的電價附加，目前征收額度標準不夠，即使從每千瓦時1.5分錢提高到1.9分錢，仍無法滿足補貼需求。征收標準的每次調整手續繁復，周期很長，還存在很大爭議。
　　
　　另一方面，因為電價附加并不能按時足額征收上來，很多自備電廠用電，還有一些省市都不按要求上繳，導致該收的收不上來。這些問題的長期存在導致了補貼拖欠，尤其是對于光伏電站，因為補貼資金占總電價的70%左右，補貼拖欠已經導致收入不能覆蓋本息，近3年建設的這些光伏項目均面臨資金鏈斷裂的風險。
　　
　　同時，現在的補貼方式隨著電力體制改革進展，也需要做改變。按照電改的方向，電價會逐步取消政府定價，形成以市場為基礎的價格形成機制，現在政府制定的火電標桿電價會逐步取消。因此，目前在火電標桿電價基礎上的補貼方式，需要做出相應調整。補貼問題如果不能有效解決，將會影響我國應對氣候變化自主承諾減排目標的實現，貽誤光伏風電產業發展的大好時機。
　　
　　結合國際經驗和我國的發展形勢，落實發電企業在完成減排目標和發展可再生能源方面的義務和責任，建立綠色電力證書交易制度，要求燃煤發電企業，按照實際燃煤發電量購買一定比例的綠色電力證書。這樣使可再生能源電力項目通過獲得市場電價，中央財政固定補貼加綠色證書交易收入等三部分，來獲得合理水平的利潤。將來隨著技術進步，成本的下降，固定補貼可以將逐步退出。
　　
　　這種市場化的可再生能源電力補貼方式，不僅是解決補貼資金來源和提高補貼效率的有效辦法，并且通過市場化交易，實現優先上網。同時，可以促使企業不斷提高管理效率和技術水平。這樣才能促進可再生能源的健康持續發展。